Bioinformatik

Auf dieser Seite finden Sie verschiedene Informationen zu der Vorlesung "Bioinformatik", die im Sommersemester 2017 von Andreas Nürnberger gehalten wird. Diese Seite wird während der Lehrveranstaltung laufend aktualisiert.

Allgemeines

Unter Bioinformatik versteht man die Entwicklung und Nutzung von Methoden und Werkzeugen der Informatik für Fragen der Biologie, wobei der Molekularbiologie in letzter Zeit besonderes Interesse zukommt. Durch die Verfügbarkeit genomischer Information ist die Biologie von einer phänomenologischen, beschreibenden zu einer analytischen, erklärenden Wissenschaft geworden. Die Analyse genomischer Information ist insbesondere aus zwei Gründen besonders schwierig: Der Datenbestand ist extrem groß und die Genome zweier Individuen sind niemals gleich. Die Bioinformatik spielt deshalb sowohl bei der Datengewinnung und -verwaltung als auch bei der Datenanalyse eine unverzichtbare Rolle.

Im Rahmen der Vorlesung werden zunächst die wesentlichen (molekular-) biologischen Grundlagen in knapper Form vermittelt. Anschließend werden die wichtigsten Methoden zur Analyse genomischer Information behandelt. Die Schwerpunkte liegen dabei auf Algorithmen zur Sequenzanalyse sowie probabilistischen Methoden. Außerdem wird ein Überblick über weitere Methoden und Techniken gegeben, beispielsweise aus den Bereichen maschinelles Lernen und Datenbanken.

Termine und Räume

  Zeit Beginn Raum
Vorlesung Mo 13:00 - 15:00 03.04.2017 G02-111
Übung Di 11:00 - 13:00 11.04.2017

G16-215

Konsultation Mi 11:00 - 13:00 19.07.2017

G29-K059

Klausur-Einsicht 23-30.08.2017 E-mail Anfrage

G29-R118

Für die anstehende Konsultation: Bündelt Fragen in Lerngruppen und schickt sie mir möglichst vor der Konsultation. Sollten Rechen-Beispiele erwünscht sein, vermerkt es in der Mail. Der genaue Raum wird noch organisiert und im Laufe der Woche bekannt gegeben.

Weitere Informationen zur Vorlesung und Übung sind im LSF verfügbar.

Lehrende

Wenn Sie Fragen zur Vorlesung oder zu den Übungen haben, wenden Sie sich bitte (bevorzugt per E-Mail) an:

Organisatorische Regelungen für die Prüfung

Am Ende des Semesters findet eine zweistündige Klausur statt. Weiteres wird in der ersten Übung bekanntgegeben.

Materialien

Vorlesung
Übung
Zusatzmaterial

Literatur

  • R. Merkl, S. Waak. Bioinformatik Interaktiv: Algorithmen und Praxis. Wiley-VHC, 2003.
  • R. Rauhut. Bioinformatik: Sequenz-Struktur-Funktion. Wiley-VHC, 2001.
  • D.E. Krane, ML. Raymer. Fundamental Concepts of Bioinformatics. Pearson Education, 2003.
  • J. Setubal, J. Meidanis. Introduction to Computational Molecular Biology. PWS Publishing Company, 1997.
  • A. M. Lesk. Bioinformatik: Eine Einführung. Spektrum Akademischer Verlag, 2002.
  • A. M. Lesk. Introduction to Bioinformatics. Oxford University Press, 2002.

Letzte Änderung: 14.08.2017 - Ansprechpartner:

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